近年来，随着乡村振兴战略的深入实施，农村经济蓬勃发展，农村自建房作为小微企业、家庭作坊及个体经营户的主要经营场所，日益成为农村经济发展的重要载体。然而，一个不容忽视的问题是，许多农村自建房在申请食品经营许可证时遭遇重重障碍，导致合法经营受限，影响了农村经济的健康发展及农民增收的步伐。

现状问题：

按目前的《营业执照》办理流程，要求经营单位应当提交租赁协议和场所的产权证明原件，而农村自建房往往难以满足这些硬性要求，从而无法取得营业执照。也就无法办理后续的《食品经营许可证》等证照。因此

目前流行的电商、外卖平台，如美团、饿了么等，商家均需要提供证照上传才能开店。无法办理证照，成为了困扰使用农村自建房商家合法合规取证经营以及参与到新业态经营的重要问题。

建议对策：

完善法规细则，分类指导：建议市场监管部门在保障食品安全的前提下，针对农村实际情况，制定更加灵活、接地气的食品经营许可标准，对小型食品作坊、农家乐等实施分类管理，降低不必要的门槛。加强基础设施建设：政府应加大对农村基础设施的投入，特别是相关配套的商业用电、用水、网络、排污系统等，改善农村经营环境，为取得农村商业经营创造条件。

优化审批流程，细化服务：优化农村食品经营许可审批流程，利用互联网+政务服务平台，提供在线咨询、申请、审核等一站式服务，同时建议由住建、消防部门对申请办证的农村自建房进行审核，确保其结构安全、消防达标，对符合条件的自建房同意办理相关手续，作为食品经营场所使用。这不仅能保障食品安全，还能促进农村自建房的合理、安全利用。

强化监管与扶持并重：在放宽市场准入的同时，加强事中事后监管，确保农村食品安全。同时，通过财政补贴、税收减免、技术培训等措施，扶持农村食品产业发展，激发市场活力，促进农民增收。

综上所述，解决农村自建房在食品经营许可方面的困境，需要政府、社会及农户共同努力，既要保障食品安全，又要兼顾农村实际，促进农村食品产业的健康有序发展。